Quando um número é excluído da conta, ele continua na aba Números como Desconectado, com um × no lugar da chave Ativo. Clique no × e depois em Salvar.
O número sai da lista, mas as conversas antigas continuam no histórico. Se o mesmo telefone for conectado de novo, ele volta para a lista sozinho — é só ligar a chave Ativo.